El Motocross de las Naciones tal y como lo conocemos ahora (tres clases y un piloto por país y clase) data de 1984, hace relativamente poco, pero el formato original es de 1946, año en el que soldados de varios países y gente del lugar compitieron en una carrera de motocross por equipos nacionales en la Inglaterra de la posguerra. Esa carrera aún no se considera la primera edición ya que no contó con el apoyo ni la organización de la FIM ni tampoco de la Auto Cyclist Union (ACU, la federación británica).
El evento fue tan bien recibido por pilotos como los improvisados organizadores y la prensa que en 1947 la FIM decidió organizar el primer Motocross de las Naciones en 1947 en un enclave al lado de un parque de atracciones a las afueras de La Haya, Holanda. Originalmente los equipos competían usando a tres pilotos llevando motos de 500cc.
Aunque durante los años ’60 se crearon dos eventos paralelos de formato idéntico (la Copa de Motocross de Naciones de 125cc y el Trofeo de Motocross de Naciones de 250cc), la historia tiende a nada más remarcar a la competición de 500cc ya que era la más prestigiosa y en aquella época todos los mejores pilotos querían competir en esa categoría.
De las 21 primeras ediciones se puede destacar el dominino abrumador de Gran Bretaña con 15 victorias por las cuatro de Suecia y las dos de Bélgica. En cuanto a organización las ediciones se fueron disputando en países de la Europa occidental, Gran Bretaña y Suecia.
En 1968 se disputó una edición en la URSS, en Chisinau (ahora capital de Moldavia), y el equipo local venció, coincidiendo con una corta era que les llevó a ganar tres títulos individuales también. A partir de 1969 se amplió el formato a cuatro pilotos por país y la era belga dio comienzo.
De 1969 a 1980 Bélgica venció en siete ediciones por tres de Suecia y una de Checoslovaquia (en casa) y otra de la URSS (en la Alemania Occidental, curiosamente). El evento tomó mucha fama en esta época y empezó a ser conocido a nivel mundial. Estrellas del momento como Joel Robert (Bélgica), Arne Kring (Suecia) y Roger de Coster (Bélgica) empezaron a correr por todo el mundo y eso dio lugar a una nueva era.